Microsoftのサポートページに解決方法がありますのでいくつかご紹介します。

■トップページの設定
　　トップページを決まったページに設定したい場合は、
　　『Internet Explorer 11 のホーム ページを変更する』
　　をご参照ください

■過去の検索文字リストの削除
　　Yahoo!やGoogleやMSNなどの検索画面で、過去に検索した文字のリストが
　　表示されるのを削除したい場合は、『パスワードを記憶して Internet Explorer 11 の Web フォームに情報を入力する』
　　をご参照ください。

■過去のWebサイト履歴の削除
　　以前表示したWebサイトの履歴を削除したい場合は、
　　『インターネット一時ファイルを削除する方法』をご参照ください。
 

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上記に参考になるFAQがない場合、Microsoftのサポートページで検索してみましょう。
様々な設定方法が記載されており非常に便利です。